São Roque é a segunda cidade da região de Sorocaba com o melhor índice de saúde primária. Os dados foram divulgados pelo Governo Federal através do eSUS Feedback, que avalia o desempenho das cidades em diversos tipos de atendimentos na rede básica, como pré-natal, acompanhamento de gestantes, consultas odontológicas, cobertura de exames e coletas de Papanicolau na Saúde da Mulher, vacinação, entre outros.

Nos últimos anos, São Roque tem mostrado um crescimento significativo nas avaliações de saúde. Em 2023, a cidade já havia saltado do 6º para o 3º lugar no antigo programa Previne Brasil, que também avaliava a saúde primária das cidades do Brasil em diversas regiões.

A melhora nos índices do município mostra um reflexo positivo das iniciativas de saúde anunciadas pela prefeitura, como a inauguração do centro de especialidades de Maylasky, a criação do Centro de Distribuição de Medicamentos, a implantação da telemedicina, entre outras iniciativas que vem sido anunciadas pela prefeitura desde 2021.